Das Kollegiatstift Unserer Lieben Frau in München wurde ab März 1803 von dem Generallandesdirektionsrat von Ritter inventarisiert und anschließend aufgehoben. Der zur Frauenkirche gehörige "Kustoreifonds" bestand weiter und wurde 1809/1810 in die Dotation der Pfarrkirche Unserer Lieben Frau überführt. Der zugehörige Akt der Spezialklosterkommission, für den ein detailliertes Aktenverzeichnis vorliegt (Kurbayern Landesdirektion von Bayern in Klostersachen 5206), konnte bisher nur zu einem geringen Teil wieder aufgefunden werden. Ilmmünster als zum Kollegiatstift Unserer Lieben Frau in München gehörige "Propstei", zu deren Verwaltung nur sporadisch der jeweils als Offizial eingesetzte Kanoniker anwesend war, wurde ab Mai 1803 ebenfalls durch den aus München abgeordneten Generallandesdirektionsrat von Ritter inventarisiert. Eine echte Kommissionsüberlieferung zum eigentlichen Aufhebungsvorgang ist nicht vorhanden, da Ritter im Herbst 1803 von München aus lediglich die Extradition der Grund- und Gerichtsuntertanen an die jeweiligen Unterbehörden initiierte. Die Besitzabwicklung vor Ort übernahm wohl der bis Juli 1804 als Administrator tätige Hofmarksrichter Andreas Köchel. Auch Indersdorf, seit der Auflösung des Augustiner-Chorherrenstiftes 1783 zum Kollegiatstift Unserer Lieben Frau in München gehörig, wurde ab Mai 1803 durch den aus München abgeordneten Generallandesdirektionsrat von Ritter zunächst nur inventarisiert. Die von diesem im Herbst 1803 begonnene Auflösung bzw. "Amtsextradition" wurde ab Dezember 1803 von Landesdirektionsrat Franz de Paula von Aichberger fortgesetzt. Im Frühjahr 1804 waren die Kommissionsgeschäfte wohl im wesentlichen beendet. Die Aktenüberlieferung ist - soweit erkennbar - leider nicht ganz vollständig. Die ebenfalls zum Kollegiatstift Unserer Lieben Frau in München gehörige Propstei Schliersee wurde ab Juni 1803 durch Generallandesdirektionsrat von Ritter aufgelöst, wozu mehrere Kommissionsakten vorhanden sind. Akten des Klosterseparats (1802-1805) und der Spezialklosterkommission (1808-1814) sind für München, Ilmmünster, Indersdorf und Schliersee in recht großem Umfang vorhanden, wenn auch nicht ganz vollständig.